第1話『どれみママになる!?』
マジョリカに忘れ物を届けるため、魔女界に向かったおジャ魔女たち。しかし女王様の庭園に迷い込んでしまい、そこで一輪のバラの中から赤ちゃんが誕生するのを発見するのでした。赤ちゃんの誕生を一番最初に見た者が一年間面倒を見るという魔女界の掟により、オジャ魔女たちの新しい生活が始まります。
第2話『赤ちゃん育ては、も～たいへん！』
赤ちゃん魔女の世話をすることになったおジャ魔女たちは、赤ちゃんを「ハナちゃん」と命名することにしました。赤ちゃんの世話などしたことのないおジャ魔女たちは、ハナちゃんの一挙一動に大騒ぎ。なかなか思うように世話が出来ず困っているところにどれみの母がやってきました。
第3話『眠っちゃダメ！ ぽっぷの見習い試験』
魔女試験が近いことを知らされるおジャ魔女たち。ぽっぷは今度こそと張り切りますが、試験のある夜に起きていられる自信がありません。そこで、ハナちゃんの夜泣きで毎晩眠れなければ、夜遅くまで起きていられると考えたぽっぷは、ハナちゃんの世話をかって出たのでした。 赤ちゃん魔女の世話をすることになったおジャ魔女たちは、赤ちゃんを「ハナちゃん」と命名することにしました。赤ちゃんの世話などしたことのないおジャ魔女たちは、ハナちゃんの一挙一動に大騒ぎ。なかなか思うように世話が出来ず困っているところにどれみの母がやってきました。
第4話『どれみはママ失格!?』
ハナちゃんをそろそろ外気浴させようと、どれみは乳母車でお散歩に出かけました。しかしある事件のせいで、ハナちゃんの面倒を放りっぱなしにします。そのせいでハナちゃんは風邪をひいてしまいました…。
第5話『さよならオヤジーデ』
関先生は母校の草花が枯れてしまいそうなのをなんとかしようと、MAHO堂に肥料を買いに来ました。おジャ魔女たちも肥料をまくのを手伝いますが、一向に改善の兆しが見えません。そんな折、久々に登場のオヤジーデがバットカードの気配を感じるのでした。。
第6話『意地っぱりとデイジーの花ことば』
デイジーを見ながら仲良く語らう、たかおとまりな。いい雰囲気の二人だったが、ＳＯＳトリオが二人の仲を冷やかしたため、たかおはまりなにひどいことを言ってしまいました。魔法を使って二人の仲をなおそうとするどれみたちでしたが、なかなか上手くいきません。まりなにあやまる決心を固めたたかおは、まりなの一番好きなデイジーの花を渡して謝ろうと、町中の花屋を探し始めます。
第7話『ハナちゃんの健康診断』
魔女界でハナちゃんの初の健康診断することになったおジャ魔女たち。もし不合格だとハナちゃんを取り上げられてしまいます！ 試験管のマジョハートは厳しいことで有名。おジャ魔女たちの力を合わせた奮闘が始まります。
第8話『時間を越えて、おんぷママの秘密を探せ！』
おんぷちゃんは、ある一大音楽祭への招待を受けますがお母さんからなぜか反対されてしまい、理由も教えてもらえません。不思議に思ったおジャ魔女たちはマジカルステージでその理由を知ろうとしますが、ステージ後には見知らぬ風景が広がっていました。
第9話『ハーブを探せ！ ＭＡＨＯ堂バスの旅』
魔女の赤ちゃんは、成長するのに魔法のハーブの栄養が必要なことを知ったどれみたちは、伊豆高原でハーブ園を営んでいる魔女のところに向かいました。マジョリリカと名乗る魔女の前でどうもマジョリカの様子がおかしい。何か秘密があるようです…。
第10話『高校生あいこは「走る少女」!?』
クラスメートの信子があいこに差し出したノートの表紙には、『走る少女 その一』と書かれていました。新作の小説をあいこに最初に読んでもらいたかったのです。小説には大きくおジャ魔女たちが登場しますが、話はまだ途中。それぞれの妄想を加速させていくおジャ魔女たちですが…。
第11話『はづきちゃん踊りを習う!?』
はづきのママは、はづきちゃんのために新しい洋服や習い事を色々与えてくれるのですが、はづきちゃんは少し食傷気味。はづきちゃんは断りたいのですが、お母さんの悲しむ顔が見たくないので、なかなか切り出せません。そんな折、ばあやがはづきの母の思い出を語ってくれるのでした。
第12話『健康診断でイエローカード！』
第２回目の健康診断がやってきました。今回の試験は赤ちゃんだけでなく、母親の技量もテストするということです。悪戦苦闘するおジャ魔女たちは、イエローカードを２つももらってしまいます。イエローカード３つで失格なのですが、最終試験でも問題が起きてしまいます…。
第13話『どれみ、お嫁さんになる？』
ＭＡＨＯ堂の出稼ぎの途中、ある牧場主催の歓迎バーベキュー・パーティーが開かれました。そこでどれみは、あろうことか牧場主の息子「大沢セバスチャン信蔵」に一目ぼれされてしまう。しかもどれみは、牧場の跡取りという肩書きに、ステーキ食べ放題という妄想に取りつかれ、信蔵のプロポーズをＯＫしてしまうのでした!!
第14話『ぽっぷの初恋？ あこがれの順一先生！』
ぽっぷのクラスにかなこ先生の補助として、新任の順一先生がやって来ました。「大人の男性ってすてき♪」と目を輝かせるぽっぷ。これにはきみたかもぽっぷ親衛隊も大ショック!!このままではぽっぷを取られてしまうと思ったきみたかとぽっぷ親衛隊は、互いに協力して順一先生に挑戦状を出したのですが…。
第15話『母の日とお母さんのにがお絵』
図工の授業でお母さんの絵を描くことになりました。ところが、クラスのしおりちゃんと矢田くんはお母さんを亡くしています。矢田くんは絵を描くことを拒否。関先生との間に気まずい空気が流れます。しかし、関先生が絵の題材としてこのテーマに決めたのには訳があるのでした。
第16話『はじめてのハイハイ!? 春風家、大パニック！』
ハナちゃんの夜泣きが激しくて、まともに眠ることが出来ないマジョリカのため、どれみはハナちゃんを１日預かることにしました。しかし、ハナちゃんはどれみの家でも魔法を使いまくります。そしてそれを必死に隠そうとするどれみの奮闘が始まるのでした。
第17話『ハナちゃんのハイハイ健診』
ハナちゃんの３ヶ月健診の課題は「ハイハイ」。前回の試験の合否が保留になっているだけに、なんとしても合格しなければなりません。幸い、今回の課題はハナちゃ んのお得意課題です。順調に課題をこなしていく赤ちゃんたちでしたが、そこで思わぬアクシデントが…！
第18話『ドドが家出しちゃった!!』
ドドの手伝いで楽の出来るようになったどれみは、調子に乗ってドドをこき使い、ドドはばてばてになってしまいます。そんな折、たった一回のミスで激怒するどれみに、ドドは大喧嘩の末家出をしてしまいます！ 怒りの収まらないどれみですが、ドドの居なくなった後、ドドのことを色々と思い出していくにつれ、考え方を改めていくのでした。
第19話『どれみとはづきの大げんか』
ハナちゃんの育児に関する出来事がきっかけで、どれみとはづきちゃんが大ゲンカをしてしまいます。あいこちゃんやおんぷちゃんも手伝って、お互い仲直りをしようとするのですが、なかなかタイミングが悪く、うまくいきません。ポップも手伝い３人で最終手段のマジカルステージを試みますが…。
第20話『お母ちゃんに会える！ あいこ涙の再会』
あいこちゃんに、お母さん・あつこからの速達の手紙が届きました。それには、今日の夕方、美空町に来るので、一晩ゆっくり会って話したいと書いてあります。しかし、その日はお父さん・幸治との約束が。どれみちゃんたちは魔法であいこちゃんに変身して、あいこちゃんをお母さんんに会いに行かせるのでした。
第21話『人間ぎらいのマジョドンと約束のハーブ』
どれみたちは魔女界の外れに住む、大問屋魔女のマジョドンから魔法ハーブのラベンダーを貰ってくるというお使いを引き受ける事になりました。屋敷に着いた一行は、人間嫌いのマジョドンに会います。彼女はなかなかハーブを分けてくれず、無理難題をおジャ魔女たちにふっかけるのでした。
第22話『魔法使いのワナ 帰ってきたオヤジーデ！』
魔法使い界の国王が、オヤジーデに、ハナちゃんをさらうようにと命じます。当初嫌がるオヤジーデですが、男爵の称号に目がくらみ、引き受けてしまうのでした。オヤジーデはあの手この手を使い、ＭＡＨＯ堂に居るハナちゃんを連れ出そうとします。
第23話『新たな力でハナちゃんをとりもどせ！』
どれみたちは魔女界の外れに住む、大問屋魔女のマジョドンから魔法ハーブのラベンダーを貰ってくるというお使いを引き受ける事になりました。屋敷に着いた一行は、人間嫌いのマジョドンに会います。彼女はなかなかハーブを分けてくれず、無理難題をおジャ魔女たちにふっかけるのでした。オヤジーデにハナちゃんを奪われて、石にされたおジャ魔女たち。マジョリカに元に戻してもらった後、ハナちゃん奪回をみんなで誓うのでした。オヤジーデの弱点を突いた作戦を練るおジャ魔女たち。果たして、ハナちゃんをぶじ取り戻せるでしょうか。
第24話『あげパンパワーおそるべし！』
商店街の相撲大会に燃える小竹くんは木村くんを誘いますが、参加するには３人グループを作らなくてはなりません。そんな時、体が太めの柳田くんを見て、もう一人のメンバーとして誘うのでした。早速小竹くんとの猛練習がはじまりますが、からきし弱い柳田くん。そんな柳田くんにやる気を出してもらおうと、おジャ魔女たちの奮闘が始まります。
第25話『謎の美少年・暁くん登場！』
ある日、気品漂うステキな少年がＭＡＨＯ堂に現れました。そこに現れるオヤジーデですが、少年は誘拐犯オヤジーデをあっさり撃退してしまいます。「暁」という名の少年はどれみたちの信用を勝ち取り、さわやかにＭＡＨＯ堂を後にするのでした。ところが、暁くんを待ち構えていたのはオヤジーデ！暁くんは新たに派遣されたオヤジーデの助手だったのでした。
第26話『かなえちゃんのダイエット作戦』
ＳＯＳは少し太めのかなえちゃんをからかい、ダイエットに成功すれば、ケーキをご馳走してやるといいます。ダイエットに奮闘するかなえちゃんですが、明らかに不健康そう…。一方ハナちゃんは、離乳食をパクパク。体重計で計ってみるとあきらかに体重オーバー。このままだと健康診断で失格になってしまいます。
第27話『北国のハーブと大切な思い出』
ハナちゃんのオムツかぶれに効く魔法ハーブが、北海道に咲いていることを知り、おジャ魔女たちは早速北海道へ行くことに。そこで偶然、どれみのお父さん・渓介がきれいな女性と釣りをしている光景に出くわしてしまいます！！仕事で飛騨に行っているはずのお父さんに「浮気！？」とばかりに詰め寄るどれみとぽっぷ。だがこれには、深い訳があったのでした…。
第28話『ねらわれた健康診断』
おジャ魔女たちはハナちゃんの検診のため魔女界に向かうのですが、偶然小さくなったオヤジーデが、どれみたちの荷物にまぎれ込んでしまいます。スキを見て現れたオヤジーデは、赤ちゃん全員を人質にして、魔女全員の水晶玉を奪い取ってしまいます。魔法が使えなくなってしまった魔女たちは、絶体絶命の大ピンチに…！
第29話『きもだめしでみんなが消えた！？』
今年も恒例の山内寺のきもだめし！まずは本堂にて怪談話、島倉さんは呪われた小学校に忍び込んだ子供たちが、１人１人消えていってしまう話をします。ところが、きもだめしを始めてみると、次々とクラスメートが消えていき、怪談話が現実となっていくのでした…！
第30話『関先生に恋人ができた！？』
夏休みが終わって今日から２学期。関先生がいつもと全く違う髪型、服装で教室に入ってきて、どこか様子がヘン。「恋人ができたに違いない」と、みんなはうわさします。帰り道、男性と一緒にいる関先生を偶然目撃したおジャ魔女たち。関先生の「結婚」の確信を深めるどれみたちは、相手がどんな人か確かめることにしました。
第31話『魔法使いの国からＦＬＡＴ４参上！』
オヤジーデの度重なるハナちゃん誘拐の失敗に、業を煮やしたオジジーデ伯爵は、オヤジーデに新たな助手を３人付けることになりました。その３人はいずれもオヤジーデの助手の暁くんの学友で、人呼んで「ＦＬＡＴ４」。ＦＬＡＴ４はさっそくおジャ魔女たちにちょっかいを出し始めます。
第32話『とんでけピュー！ドドたちの大変身』
はづきちゃんと外出したハナちゃんを、ＦＬＡＴ４のレオンとトオルは魔法でウサギのぬいぐるみにすりかえ、連れ去ってしまいました！！ おジャ魔女たちは直ぐに捜索を開始すると、オヤジーデを発見。早速ハナちゃんの居場所を問いただしますが…。
第33話『遠足はみんなでハイチーズ！』
今日は美空小学校の遠足の日。トラブルを逃さずシャッターを切る写真係の島倉さんは、おんぷの「デリカシーがないわ」という忠告にも聞く耳を持ちません。そんな折、記念写真を撮ろうとしている老夫婦と出会い、島倉さんがシャッターを押してあげる際、今まで考えていなかったことが解るのでした。
第34話『たこ焼きは仲なおりの味』
ＭＡＨＯ堂でみんなが育てている「魔法の実のなる木」につぼみがつきました。でもあいこのだけがまだつきません。そこにやってきたおんぷちゃんの一言にカチンと来たあいこは口論になってしまいます。どれみたちは、あまり感情を表に出さないおんぷちゃんの気持ちを、魔法を使って探ろうとします。
第35話『運動会でてっぺんをめざせ！』
運動会を目前に控えたソナチネ幼稚園で、ぽっぷは大好きな順一先生が教えてくれる組体操に燃えていました。しかし、きみたかのグループのピラミッドが上手く出来ません。きみたかがピラミッドのてっぺんにこだわるのには、大切な理由があるようです。
第36話『あいこがライバル！スポーツ勝負！！』
あいこちゃんの気を引こうとしたレオンは、バスケットの勝負を挑むとコテンパンに打ち負かされてしまいました。ハナちゃんの誘拐そっちのけで、スポーツ勝負で打倒あいこを誓います。しかし、そんな勝負の最中にハナちゃんがいなくなってしまったのです！
第37話『ハナちゃんもぽっぷも試験中！』
今夜はハナちゃんの健康診断。ところが、偶然にもぽっぷの４級魔女見習試験と重なってしまいました。ぽっぷが心配などれみは、ぽっぷの応援に行きたいのですが、当然健診を離れるわけにはいきません。そんなどれみをよそに、ぽっぷは自信満々で魔女界へ行きます。
第38話『はづきちゃんは名監督！』
信子の書いたシナリオで劇をやることになった４年２組は、お父さんが映画監督をしているはづきちゃんが監督をすることになりました。何をすればいいのか解らないはづきでしたが、どれみやあいこに励まされ、積極的に皆に指示を出します。ところが、主役のおんぷちゃんが映画の出演で出られなくなってしまったのです。
第39話『わがままっ子と怒ったかいじゅう』
撮影の為に健診に来られなかったおんぷに報告しに行くという名目で、京都に行くどれみたち。ところが、ワガママし放題のジャリタレ少年の嫌がらせによって撮影現場を追い出されてしまいます。普段は良い子らしいのですが、どうやら今日のかんしゃくの原因は、普通の幼稚園児としての小さな希望があるようです。
第40話『春風家にピアノがやってくる！』
「ピアノを教えて」とお母さん・はるかにお願いするぽっぷ。どれみにはピアノを教えたはるかが、自分には教えなかった理由をどれみから聞いて、素直な気持ちを伝えたのでした。しかし春風家にはもうピアノはありません。そこでお父さん・渓介に相談して、購入の算段を始めるのでした。
第41話『おんぷに追いつけ！アイドルへの道！』
ＴＶドラマの収録で、おんぷちゃんと共演予定の赤ちゃんが体調不良で来られなくなってしまって、なんとハナちゃんが代役に！撮影が開始されると、突然カメラの前に現れるＦＬＡＴ４のトオル。ＴＶアイドルたちのモテモテぶりをみて「絶対僕の方がイケてる！」と、ハナちゃん誘拐とＴＶ出演の一石二鳥を目論んでやってきたようです。
第42話『魔法をつかわない魔女』
健康診断に合格した帰り道、魔法を使わない不思議な魔女・マジョランと出会います。彼女はどれみとハナちゃんを乗せたまま車を急発進！ 彼女は女王様に会うために、どれみたちを人質にして、女王様のお城めがけて疾走しますが…。
第43話『ハナちゃんはクラスメイト！？』
マジョリカとララが、風邪で熱を出して寝込んでしまいました。とてもハナちゃんの世話どころではありません。仕方なしにおジャ魔女たちは、ハナちゃんを学校に連れて行くことにしました。しかし、これ幸いとハナちゃん誘拐を目論むＦＬＡＴ４が、学校にやってきてしまいます。
第44話『幸せのホワイト・クリスマス』
クリスマスイヴ、夜に集まってクリスマスパーティーをしようとどれみが提案し、みんなも賛成。でも、夜までは家族とのクリスマスイブをそれぞれ過ごすことになりました。そうして始まったおジャ魔女たちのクリスマスイヴ。一体どうなることでしょう…。
第45話『おジャ魔女時代劇・少女よ大志をいだけ！』
時は幕末。美空藩城下町の町娘、どれみ、はづき、あいこ、おんぷは、観音堂でハナと名付けられた捨て子を見つけ途方に暮れている長屋に住む浪人と出会いました。心配するどれみたちは一緒に面倒を見てあげることを約束します。浪人の元に通うどれみたちは長屋の子供たちとも仲良くなり、浪人の所に自然と子供たちが集まるようになっていくのでした。
第46話『最後の健診・ハナちゃんはママが守る！』
最後の健診を合格する為に気を引き締めて会場に向かうどれみたち。最後の健診の課題は、「なんでもいいから言葉を話すこと」です。 テキやテキパキたちは次々に合格して行くが、ハナちゃんに言葉を話させるなど、どうすればいいのか分らない。すると、困る４人の耳に「大丈夫」と謎の声が。声の主はハナちゃんを手にしたＦＬＡＴ４。「僕たちの目的は、はじめからその赤ん坊だったんだ」と暁は衝撃の告白します！
第47話『ハナちゃんを返して！魔法大決戦』
ハナちゃんがオヤジーデにさらわれてしまった！ＦＬＡＴ４はおジャ魔女たちと和解し、魔女界と魔法使い界の戦争に発展するのを回避するために、息の合った魔法でオヤジーデと伯爵を追い詰めます。ハナちゃんを返してもらうため、どれみはオヤジーデに必死に訴えますが…。
第48話『ハナちゃんが死んじゃう！？』
ハナちゃんが高熱を出してしまいました！おジャ魔女たちの懸命の看病にもかかわらず、一向に回復の気配がありません。女王様に相談すると、「ラブシュプリーム」というひとつだけ願い事をかなえてくれる花を見つけ出せば可能だとのことですが、それは恐ろしい呪いの森にあり、しかも無償の愛を持つものにしか摘むことが出来ないのだといいます。しかし、どれみたちの決心はもう決まっています。４人で呪いの森に向かうことにしたのです。
第49話（最終回）『さよならハナちゃん』
呪いの森はやはり恐ろしいところでした。次々とおジャ魔女たちに、それぞれの希望がかなう幻影が襲いかかります！！幻影に惑わされながらも、ハナちゃんへの気持ちをしっかり持ちつつ、おジャ魔女たちは前に進もうとします。はたして、ハナちゃんを助けることが出来るのでしょうか？そして、水晶玉を失ったおジャ魔女たちは…。