第1話『いくぞ！ラッシュデュエル！』
王道遊我(おうどうゆうが)は「ロード」と呼ぶ自分の発明でキュークツなデュエルの世界を変えたいと考えていた。 ある日、「デュエルの王」を目指す隣のクラスのルークからある伝説を聞く。 ルークと共にたどり着いた先には謎の石碑(せきひ)があり、そこにはホログラムの男が待ち受けていた。遊我が「デュエルの王」として認められるためには、制限時間内に勝利して新しいルールをインストールしなければならない！ 「僕の考えたロード、“ラッシュデュエル”ならできる！」
第2話『悪魔を飼う男』
ホログラムの男を打ち破り、ラッシュデュエルをインストールした遊我たち。 デュエルを管理するゴーハ社に秘密にしようとするルークと「みんなで楽しくデュエルがしたいだけ」とオープンな姿勢の遊我が対立する。２人がラッシュデュエルで対決することに！
第3話『ロミンの秘密』
広がったラッシュデュエルにゴーハ社からの削除の手が伸び始めるが、遊我たちに直接接触してくる様子はない。 泳がされている、と感じたルークたちは、あやしい動きをするロミンを調べ始める。 遊我がロミンの気を引くようにラッシュデュエルをすすめるが…。
第4話『さよなら、生徒会長！』
ゴーハ７小生徒会長、蒼月学人(そうげつがくと)は自分のふるまいに悩んでいた。ラッシュデュエルを認めるか否か。 そんな朝、毎日の日課であるカード占いで引いたカードは自分のエースモンスター「魔将ヤメルーラ」だった。ヤメルーラを見てガクトは何かをひらめく。
第5話『ルーク、男の闘い』
遊我たちのもとへ学校の新聞部が取材にやってきた！紙に印刷された新聞なら、ネットを監視するゴーハの目にとまらずルールを広められる!? しかし、新聞部の目的はラッシュデュエルを“底の浅いルール”と決めつけることだった！ラッシュデュエルを悪く言われたルークは怒りにふるえ、立ち上がる！
第6話『御麺！ラーメンデュエル！』
７小新聞のおかげで、ラッシュデュエルが街に広まり始めた。記事の中で、行きつけの食堂が閉店することを知った遊我たちは、閉店前に名物のラーメンを食べようと向かう。店主が作るラストラーメンをめぐり、グルメデュエリスト麺三郎と前代未聞(ぜんだいみもん)のラーメンデュエル？の幕が開く！
第7話『転校生は小学生？』
ラッシュデュエルを消すことに苦戦していたゴーハ社が注目したのは、遊我が持っている“秘密のノート”だった。 そしてゴーハ社６人の幹部である“トップ・オブ・ヘキサゴン”の１人が転校生として７小へ送り込まれてきた。 遊我たちは大人たちの手からラッシュデュエルを守れるのか？
第8話『世紀末とナポリタン』
ものすごーく暑い日差しの中、遊我たちが飲み物を買おうと自動販売機へ向かうと、巨大な影が立ちふさがった。 なぜかルークに恨みを持っていて“世紀末決闘王”を名乗るヨシオが、ルークにラッシュデュエルを挑んでくる！強大な力の源(みなもと)はスパゲティナポリタンにあった！?ルークは一体どう戦うのか？
第9話『素敵なジュラシック』
ゴーハ市に“ゴッシー”という恐竜が出現した、という噂が聞こえてきた。恐竜に男のロマンを感じると意気投合した遊我とルークの２人はさっそく市内を探索開始！ すると、ゴッシーの正体を“ラッシュデュエル恐竜”であると考えるゴーハ２小の伯佛(はくぶつ)カンたちに出会う。 ルークの案内で彼らと市内をめぐる遊我たちは、カンたちのゴッシー探しには興味以外に別の目的があることに気づいて…。