第1話『第2小隊出動せよ!』
舞台は近未来。続発するレイバー犯罪に対抗するために、警視庁はパトロール・レイバー隊を設立。高校を卒業したばかりの新米警官・泉野明は、レイバーの操縦担当を任される。彼女の前には如何なる難事件が待ち受けているのだろうか!?
第2話『ロングショット』
ニューヨーク市長を護衛する第二小隊。しかし、厳重な警備をかいくぐり、テロリストの時限式ランチャーが市長を狙う。解体を任された遊馬の、イチかバチかの大バクチ=ロングショットがはじまった!
第3話『四億五千万年の罠』
待ってましたの怪獣退治!東京湾に謎の巨大生物出現。マッドサイエンティスト、平田博士が生み出したモンスターがレイバーに迫る!レイバー隊VSモンスター、決戦の時は近い!!
第4話『Lの悲劇』
再訓練を命じられた野明たちが富士の隊員養成所で体験した不思議な出来事とは?少女の幽霊、闇の中を彷徨うレイバーの亡霊…。いったい、ここで何が起きたというのか!?
第5話『二課の一番長い日(前編)』
冬期休暇を迎えた特車隊。しかし、庁舎の周囲には不穏な人影が…。折しも、東北縦貫道でレイバー犯罪発生!恐るべきクーデター計画が日本を、そして特車隊に襲いかかろうとしていた。
第6話『二課の一番長い日(後編)』
クーデター勃発!甲斐の率いる反乱軍が東京の中枢を支配した。核ミサイルを武器に日本支配を謀る反乱軍に、後藤隊長率いる特車二課は奇襲作戦をしかける。日本の運命をかけた戦いの火蓋が切って落とされる!
第7話（最終回）『特車隊、北へ!』
国際レイバーショウに参考出展される軍用レイバーがテロリストに盗まれ、さらに何者かによってトレーラーが強奪される。犯人の目的は一体…。特車二課の面々は地元警察と捜査に乗り出すが、意外な犯人像が浮かび上がる…。