第1話『王子様の帰還』
『ちぃーす』 中学テニス全国大会から数か月後･･･。日本テニス界のトップ選手を育成するU-17（アンダーセブンティーン）日本代表合宿に、全国優勝を成し遂げた青学（せいがく）を始め、氷帝、立海など実力ある中学生選手が集められた。 しかし、合宿参加早々、彼らはふるいにかけられる。空から落ちてくるボールを拾うことが出来ない者は即刻帰れと言うのだ。余裕でボールを拾う中学生たちの中、拾えない高校生が続出！そして最後の一つ･･･。 そのボールを取ったのはアメリカに武者修行に出ていたリョーマだった。
第2話『地獄の番人』
『そんじゃ早速、行かせてもらうっすよ。鬼退治！』 無事、U-17（アンダーセブンティーン）日本代表合宿に残った中学生。 豪華な施設での合宿に浮かれ気分の彼らだったが、そこへ上位コート所属の高校生との入れ替えを賭けたシャッフルマッチが発表される。その対戦相手は青学（せいがく）・桃城武と5番コート所属・鬼十次郎。奇しくも同じパワープレイヤー同士の対決となった。上がってくるものをことごとく退けることから「地獄の番人」と恐れられる鬼に、桃城は果敢に得意のジャックナイフで挑んでいく。しかし、鬼はそれを上回るブラックジャックナイフを繰り出してきて―。
第3話『同士討ち』
『…それではこれからシングルスの試合を始めます』 精神（メンタル）コーチ・齋藤が中学生たちに課した課題は、ペア同士の対決「同士討ち」だった。負けた方は脱落と言う非情なルールに困惑を隠せない中学生たち。 それぞれ複雑な思いを抱きながら試合に臨むが、青学（せいがく）の菊丸だけはいつまでたっても、気のないプレイを続けていた。そんな本気を出そうとしない相棒の様子に、怒りをあらわにする大石。この試合が終わったらもう一緒にダブルスが出来なくなってしまうことを悲しむ菊丸に、大石は自分は勝って生き残ると宣言する。
第4話『部長の選択』
『考えることは一緒のようだ…』 負けた方が脱落してしまうペア同士の戦い。続いて、青学（せいがく）・手塚ｖｓ海堂、氷帝・跡部ｖｓ日吉の部長と2年生の対決が始まる。 憧れの部長との対決に並々ならぬ思いで挑む海堂と日吉だが、海堂は手塚の百錬自得の極みの前に、思うように試合が出来ず大差をつけられてしまう。一方、日吉は跡部を相手にタイブレークで堂々と渡り合い、２組の試合展開はそれぞれ対照的なものとなっていた。 しかし、どうやらこの試合、手塚と跡部の思惑は同じのようで…。 その頃、単独行動を起こしたリョーマと金太郎は、徳川と鬼に遭遇。勝負を挑んでいた。
第5話『勝者そして敗者』
『…こんなものか』 ペア同士の試合が続く最中、別の場所ではリョーマと徳川、金太郎と鬼の戦いが始まっていた。自分の得意技を次々繰り出し、相手を全く寄せ付けないリョーマと金太郎。高校生との試合に期待をしていた二人は、あまりの手ごたえのなさに拍子抜けしてしまう。そしてまた、同様に徳川と鬼も、二人の実力に失望を感じていた。 これで終いだとばかりに、徳川と鬼がとうとう本気をみせる！ いよいよ高校生の実力が明らかに！！果たしてリョーマと金太郎は本気の高校生に勝つことが出来るのか！？
第6話『心の崖』
『我々全員で這い上がるぞ！』 中学生の脱落者が決定し、帰宅の途に就くはずの負け組たちは、何故か山奥へと連れてこられていた。そして、そこには精神（メンタル）コーチの齋藤と、リョーマ、金太郎の姿が。勝ち組と差を広げられたくないのなら、この山を登ってはどうかと言う齋藤の提案に、負け組たちは山を登ることを決意する。ところが、この山、そんなに甘くはなかった！ 体力的にも精神的にも厳しい道のりを進む負け組たち。果たして彼らは、無事に山を登りきることが出来るのか！？そして、この山を登り切った先に彼らを待つものは一体―！？
第7話『ゼロからのスタート』
『…負け組諸君…地獄へようこそ』 やっとの事で崖を登り切ったリョーマたち負け組メンバー。そこに待っていたのは、すでに脱落したはずの高校生たちと、U-17（アンダーセブンティーン）日本代表・裏コーチを務める三船入道だった。 三船は特訓と称し、中学生たちに次々と課題を与えていくが、その内容はどれも自分たちの力になるとは思えない不可思議なものばかり。三船や高校生に対し、イライラを募らせながらも中学生たち自分たちの成長のため、必死に課題をこなしていく。そして、１日の終わりに夜のねぐらをかけて、高校生と中学生の試合が行われることになった。
第8話『スペシャルミッション』
『職員用バーラウンジにある、極上の酒を確保せよ』 ある真夜中…。リョーマ、田仁志、謙也の３人に三船よりスペシャルミッションが与えられる。それは、U-17 （アンダーセブンティーン）日本代表の合宿所に忍び込み、練習用品と酒を盗んでくるというものだった。 何とか合宿所への潜入に成功した３人は、難なく備品を入手することに成功。続いて、問題の酒があるバーラウンジに向かうが、そこにたどり着くには数々の罠が待っていた！ 果たして、リョーマ、田仁志、謙也は無事に酒を持ち帰ることが出来るのか!?
第9話『進化と変化』
『もしかして…あの三船って人…実はものスゴいコーチなんじゃねぇか…？』 着々と三船の特訓をこなしていくリョーマたち。ある日、三船の発案により新たな特訓が行われることになる。それは……「スポーツマン狩り」！！ 各々に与えられた風船には鷲の好きな匂いが塗ってあり、風船が割られないよう逃げなくてはならないという。割られた者は即刻アウトというルールに鷲から必死に逃げる中学生たちだが、その中で彼らは自分の進化を目の当たりにする！ 一方その頃、勝ち残った中学生たちは高校生とのシャッフルマッチで驚異の快進撃を果たしていた。
第10話『さらば 手塚国光』
『…これからは、自分の為だけに戦ってください…！』 とうとう３番コートと５番コートのシャッフルマッチが始まった。シングルス２で登場した青学（せいがく）の部長・手塚は、かつて青学（せいがく）の部長を務めていた大和祐大と対戦することになる。 大和の繰り出す「幻有夢現（げんうゆめうつつ）」を返すことが出来ない手塚は「手塚ファントム」を使い、すべてのボールをアウトにすることで勝利を掴もうとしていた。しかし、ひじに大きな負担がかかるこの技を見て大和は、常に自分を犠牲にし、チームのために戦ってきた手塚に自分のために戦ってほしいと語りかける。それを聞いた手塚は…。
第11話『約束』
『勝つのは５番コートだ！』 手塚の思いを継いだ跡部が満を持してシングルス１に登場する。相手は３番コートの中心的存在である入江奏多。試合は序盤から、この合宿で驚くべき進化を遂げた跡部がその力を見せつけ、圧倒的なワンサイドゲームで入江を５－０と突き放す。その差に誰もが５番コートの勝利を確信した瞬間、ついに入江が隠していた実力を明らかにする！ 跡部に牙をむく入江のテニス。最後に勝利を手にするのは５番コートか、それとも３番コートか!?シャッフルマッチ最終戦の火蓋が切って落とされる！
第12話『革命の火蓋』
『俺は絶対、先に山を降りるけどね』 ノーゲームに終わった跡部と入江の試合。代表戦に自ら名乗りを上げた鬼は、圧倒的な強さで勝利を収め、ついに５番コートの中学生たちは３番コートへと勝ち上がった。 一方、負け組にはこの山から降りるための最終特訓が行われる。三船は、これまで以上に厳しい練習を課すが、負けじと必死に食らいついていく負け組の面々。そして、中学生たちには三船から最終試験が言い渡された。 いよいよ負け組の進化が試される。リョーマたち中学生は無事、山を降りることが出来るのか!？
第13話（最終回）『輝ける君たちへ』
『リベンジに来たっス』 革命軍の証である黒ジャージを着て戻ったリョーマたちは、２番コートに試合を持ちかけていた。傷だらけな中学生を見てせせら笑う２番コートの高校生だったが、これまで地獄の特訓を乗り越えてきた中学生と２番コートの高校生との実力差は明白であった。負け組と言われた中学生たちは見事な勝利で２番コートの座を勝ち取り、再び、Ｕ－１７（アンダーセブンティーン）日本代表合宿へと帰還するのだった。 そして、リョーマはあの日の雪辱を果たすべく、一人練習する徳川の前に現れた…。
新テニスの王子様 氷帝 vs 立海 Game of Future
U-17杯を終え、各校の選手たちはそれぞれの日常へと戻った。3年生が部の引退と卒業を控え、2年生がチームの軸になっていく、そんな時期。跡部財閥は湘南にテニスコートを新設。そこで行われるエキシビションマッチの相手に跡部は、立海大附属中を指名する。